最大的困難當然來自市場，現在硅光模塊的價格優勢和性能優勢體現的都不明顯，經常在市場上競爭不過傳統廠商，如果不是在相干等特定領域，還有Intel這樣的大公司支持，小硅光公司很難生存，所以才有Rockley光子這樣的公司轉型去做傳感產品。

硅光技術上的困難來自設計方與生產工藝的磨合。傳統的CMOS產線不能直接拿來做硅光，要做很多的改造。還有，硅光現在不能做激光器，如何加外部光源以及耦合對準是個挑戰，不同公司有不同的方案，也出現了POET這樣的提供中間方案的公司。再有就是硅光波導現在的損耗比較大，因此要求光源的功率更高，也帶來設計制造的困難。